Gene: NADH dehydrogenase 5 (ND5) Species: Trypanosoma brucei Edited/unedited: not edited Notes: DNA ATGTTTTTAATATTTTTTTTATTTTTTATAATGTTTGGGTTTATATCAGGTTCATTTATG 1 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 60 AA M F L I F F L F F I M F G F I S G S F M 1 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 20 TTTGGTAGGAATTTTCTAAGTTTTTGATTATCTTTAGTAATGATAATATTTATTGTATTG 61 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 120 F G R N F L S F W L S L V M I I F I V L 21 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 40 TGTATGATATTTAGTTTTTTAATGGTATCAGTATGTTTATACGGTTATTATTATTACGAT 121 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 180 C M I F S F L M V S V C L Y G Y Y Y Y D 41 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 60 TTTTGTTTAATACTAATGTTAGATTTTTGTTTTATATGATTAACATACGTATGTTCAGGT 181 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 240 F C L I L M L D F C F I W L T Y V C S G 61 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 80 TTTTATATGTTTATAATGTTATTGATAAATATGGTATTTTGTTTTATAGTATTTTACGCA 241 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 300 F Y M F I M L L I N M V F C F I V F Y A 81 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 100 TTTTATTATATGTATTTTGATATGTTGTTAGGGCGTTTTTTGATTATATTTTGAATATTT 301 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 360 F Y Y M Y F D M L L G R F L I I F W I F 101 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 120 GTTGTGTGCATGAATTTATTCATCCTATCATATGATTTTTTAACAGCTTACTGCGGATGA 361 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 420 V V C M N L F I L S Y D F L T A Y C G W 121 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 140 GAATTATTAGGGTTATTCTCATTTTTTTTAATTTCATATTTCTGATACCGTTTTTTTGCA 421 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 480 E L L G L F S F F L I S Y F W Y R F F A 141 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 160 TTAAAATTTGGTTTTAAAGCTTTTTTTATAGGTAAAATAGGAGATGTGTTATTAATATTC 481 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 540 L K F G F K A F F I G K I G D V L L I F 161 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 180 GCTTTTTCTATAATATTTTTATCAAATGGTTTTTGTATGACAACTTTTTATTTTTTAAAT 541 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 600 A F S I I F L S N G F C M T T F Y F L N 181 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 200 TTTTTTTGTATGGATTATTATTATATAGAATTTTCTATATGTTTGTTAGTAGGATGTGCG 601 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 660 F F C M D Y Y Y I E F S I C L L V G C A 201 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 220 TTCACAAAAAGTACACAATTCGGCTTACATATATGATTACCAGATGCTATGGAAGGACCT 661 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 720 F T K S T Q F G L H I W L P D A M E G P 221 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 240 ATCCCAGTATCAGCATTAATACACGCAGCTACATTAGTTGTTTGTGGAATAATATTATTA 721 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 780 I P V S A L I H A A T L V V C G I I L L 241 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 260 AGTTTTGTTTATTGATGTTTTGATTTTTGATTTAGTTATTTTTATAATTTGATAGGATGG 781 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 840 S F V Y W C F D F W F S Y F Y N L I G W 261 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 280 TCTACATTAATTTTAATATTAATGACATTGTGTGTGTTTTATAATTTTGACGTAAAACGA 841 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 900 S T L I L I L M T L C V F Y N F D V K R 281 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 300 TACGTAGCGTTCAGTACAATATGTCAAATTAGTTTTTCTATGTTTTGTTGTCTGTGTATA 901 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 960 Y V A F S T I C Q I S F S M F C C L C I 301 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 320 GATATATATATAGGTAGTTTATTTTTTTGTTACCATATGTTCTACAAAGCAACATTATTT 961 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1020 D I Y I G S L F F C Y H M F Y K A T L F 321 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 340 ATAGTATTAGGTATATGAATACATATATTTTTTGGGTTACAGGATTTAAGATGTTATTTT 1021 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1080 I V L G I W I H I F F G L Q D L R C Y F 341 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 360 TTTATGTATTTTTGTGGTTGTGTGTTAGCGCGTTTGTTATTAATATTCGCAATATTAAAC 1081 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1140 F M Y F C G C V L A R L L L I F A I L N 361 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 380 TCATGTTCAATTTGATTTTTATGTGGTTTTTATTGTAAGGATATGTTATTAGCTTTATTG 1141 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1200 S C S I W F L C G F Y C K D M L L A L L 381 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 400 ATGTTATTATCATTTTATAATATAATAGAATTTTTGTTTATAAGTATAATTTTTATATTT 1201 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1260 M L L S F Y N I I E F L F I S I I F I F 401 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 420 TTTACAATGATTTATAATTATTTTTTGTTATTTTTTTTGATGTTTGTGTTCAAATGTTTT 1261 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1320 F T M I Y N Y F L L F F L M F V F K C F 421 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 440 TGTTTGGTTGATTGTTTATTTTTATTATTTGATTATGAATGTTGTTTAGTATATTGTTTG 1321 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1380 C L V D C L F L L F D Y E C C L V Y C L 441 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 460 ATAAGTTTGTATATGTGTATTTTAAGTATATTTTTTATAATAGATTTTGTATGTATATTT 1381 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1440 I S L Y M C I L S I F F I I D F V C I F 461 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 480 GTATTTTCAAGTTATTGTGTATTTTGATCATTTTTTTTAAATTTTTATAATTTTTTTGAT 1441 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1500 V F S S Y C V F W S F F L N F Y N F F D 481 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 500 ATAGCAATTTTTGTGGTTTTTTTAATATTATCAGTAGGATTTTTATATTATGGTTGTTTA 1501 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1560 I A I F V V F L I L S V G F L Y Y G C L 501 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 520 TTTTTTTATTTTTTCAATATAGATTGCATAATGTTGTTTTGGAGAATTTTTTTTGTAATA 1561 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1620 F F Y F F N I D C I M L F W R I F F V I 521 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 540 ATAATTTTAGTAGTATTTATGATATTTTGTTGTTGATATTTTGTTTGTATGATCATATTT 1621 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1680 I I L V V F M I F C C W Y F V C M I I F 541 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 560 ATGTTATTATTTGTATGAAATTTTGTTATATATTTTAGATATAATTTGAAATATTGTTTA 1681 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1740 M L L F V W N F V I Y F R Y N L K Y C L 561 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 580 TTTTTTTGTATTTTGTGAATATTGTATGTATAA 1741 ---------+---------+---------+--- 1773 F F C I L W I L Y V * 581 - - - - - - - - - + 590