Gene: NADH dehydrogenase 5 (ND5)
Species: Trypanosoma brucei
Edited/unedited: not edited
Notes:



 
DNA      ATGTTTTTAATATTTTTTTTATTTTTTATAATGTTTGGGTTTATATCAGGTTCATTTATG  
       1 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  60
AA       M  F  L  I  F  F  L  F  F  I  M  F  G  F  I  S  G  S  F  M   
       1 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    20


         TTTGGTAGGAATTTTCTAAGTTTTTGATTATCTTTAGTAATGATAATATTTATTGTATTG   
      61 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  120
         F  G  R  N  F  L  S  F  W  L  S  L  V  M  I  I  F  I  V  L   
      21 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     40


         TGTATGATATTTAGTTTTTTAATGGTATCAGTATGTTTATACGGTTATTATTATTACGAT
     121 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  180
         C  M  I  F  S  F  L  M  V  S  V  C  L  Y  G  Y  Y  Y  Y  D   
      41 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     60


         TTTTGTTTAATACTAATGTTAGATTTTTGTTTTATATGATTAACATACGTATGTTCAGGT
     181 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  240
         F  C  L  I  L  M  L  D  F  C  F  I  W  L  T  Y  V  C  S  G   
      61 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     80


         TTTTATATGTTTATAATGTTATTGATAAATATGGTATTTTGTTTTATAGTATTTTACGCA
     241 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  300
         F  Y  M  F  I  M  L  L  I  N  M  V  F  C  F  I  V  F  Y  A   
      81 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    100


         TTTTATTATATGTATTTTGATATGTTGTTAGGGCGTTTTTTGATTATATTTTGAATATTT
     301 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  360
         F  Y  Y  M  Y  F  D  M  L  L  G  R  F  L  I  I  F  W  I  F   
     101 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    120

         GTTGTGTGCATGAATTTATTCATCCTATCATATGATTTTTTAACAGCTTACTGCGGATGA
     361 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  420
         V  V  C  M  N  L  F  I  L  S  Y  D  F  L  T  A  Y  C  G  W   
     121 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    140

         GAATTATTAGGGTTATTCTCATTTTTTTTAATTTCATATTTCTGATACCGTTTTTTTGCA
     421 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  480
         E  L  L  G  L  F  S  F  F  L  I  S  Y  F  W  Y  R  F  F  A   
     141 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    160

         TTAAAATTTGGTTTTAAAGCTTTTTTTATAGGTAAAATAGGAGATGTGTTATTAATATTC
     481 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  540
         L  K  F  G  F  K  A  F  F  I  G  K  I  G  D  V  L  L  I  F   
     161 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    180

         GCTTTTTCTATAATATTTTTATCAAATGGTTTTTGTATGACAACTTTTTATTTTTTAAAT
     541 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  600
         A  F  S  I  I  F  L  S  N  G  F  C  M  T  T  F  Y  F  L  N   
     181 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    200


         TTTTTTTGTATGGATTATTATTATATAGAATTTTCTATATGTTTGTTAGTAGGATGTGCG
     601 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  660
         F  F  C  M  D  Y  Y  Y  I  E  F  S  I  C  L  L  V  G  C  A   
     201 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    220


         TTCACAAAAAGTACACAATTCGGCTTACATATATGATTACCAGATGCTATGGAAGGACCT
     661 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  720
         F  T  K  S  T  Q  F  G  L  H  I  W  L  P  D  A  M  E  G  P   
     221 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    240


         ATCCCAGTATCAGCATTAATACACGCAGCTACATTAGTTGTTTGTGGAATAATATTATTA
     721 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  780
         I  P  V  S  A  L  I  H  A  A  T  L  V  V  C  G  I  I  L  L   
     241 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    260


         AGTTTTGTTTATTGATGTTTTGATTTTTGATTTAGTTATTTTTATAATTTGATAGGATGG
     781 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  840
         S  F  V  Y  W  C  F  D  F  W  F  S  Y  F  Y  N  L  I  G  W   
     261 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    280


         TCTACATTAATTTTAATATTAATGACATTGTGTGTGTTTTATAATTTTGACGTAAAACGA
     841 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  900
         S  T  L  I  L  I  L  M  T  L  C  V  F  Y  N  F  D  V  K  R   
     281 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    300


         TACGTAGCGTTCAGTACAATATGTCAAATTAGTTTTTCTATGTTTTGTTGTCTGTGTATA
     901 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  960
         Y  V  A  F  S  T  I  C  Q  I  S  F  S  M  F  C  C  L  C  I   
     301 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    320


         GATATATATATAGGTAGTTTATTTTTTTGTTACCATATGTTCTACAAAGCAACATTATTT
     961 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1020
         D  I  Y  I  G  S  L  F  F  C  Y  H  M  F  Y  K  A  T  L  F   
     321 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     340


         ATAGTATTAGGTATATGAATACATATATTTTTTGGGTTACAGGATTTAAGATGTTATTTT
    1021 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1080
         I  V  L  G  I  W  I  H  I  F  F  G  L  Q  D  L  R  C  Y  F   
     341 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     360


         TTTATGTATTTTTGTGGTTGTGTGTTAGCGCGTTTGTTATTAATATTCGCAATATTAAAC
    1081 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1140
         F  M  Y  F  C  G  C  V  L  A  R  L  L  L  I  F  A  I  L  N   
     361 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     380


         TCATGTTCAATTTGATTTTTATGTGGTTTTTATTGTAAGGATATGTTATTAGCTTTATTG
    1141 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1200
         S  C  S  I  W  F  L  C  G  F  Y  C  K  D  M  L  L  A  L  L   
     381 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     400


         ATGTTATTATCATTTTATAATATAATAGAATTTTTGTTTATAAGTATAATTTTTATATTT
    1201 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1260
         M  L  L  S  F  Y  N  I  I  E  F  L  F  I  S  I  I  F  I  F   
     401 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     420


         TTTACAATGATTTATAATTATTTTTTGTTATTTTTTTTGATGTTTGTGTTCAAATGTTTT
    1261 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1320
         F  T  M  I  Y  N  Y  F  L  L  F  F  L  M  F  V  F  K  C  F   
     421 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     440


         TGTTTGGTTGATTGTTTATTTTTATTATTTGATTATGAATGTTGTTTAGTATATTGTTTG
    1321 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1380
         C  L  V  D  C  L  F  L  L  F  D  Y  E  C  C  L  V  Y  C  L   
     441 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     460


         ATAAGTTTGTATATGTGTATTTTAAGTATATTTTTTATAATAGATTTTGTATGTATATTT
    1381 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1440
         I  S  L  Y  M  C  I  L  S  I  F  F  I  I  D  F  V  C  I  F   
     461 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     480


         GTATTTTCAAGTTATTGTGTATTTTGATCATTTTTTTTAAATTTTTATAATTTTTTTGAT
    1441 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1500
         V  F  S  S  Y  C  V  F  W  S  F  F  L  N  F  Y  N  F  F  D   
     481 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     500

 
         ATAGCAATTTTTGTGGTTTTTTTAATATTATCAGTAGGATTTTTATATTATGGTTGTTTA
    1501 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1560
         I  A  I  F  V  V  F  L  I  L  S  V  G  F  L  Y  Y  G  C  L
     501 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     520


         TTTTTTTATTTTTTCAATATAGATTGCATAATGTTGTTTTGGAGAATTTTTTTTGTAATA
    1561 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1620
         F  F  Y  F  F  N  I  D  C  I  M  L  F  W  R  I  F  F  V  I   
     521 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     540


         ATAATTTTAGTAGTATTTATGATATTTTGTTGTTGATATTTTGTTTGTATGATCATATTT
    1621 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1680
         I  I  L  V  V  F  M  I  F  C  C  W  Y  F  V  C  M  I  I  F   
     541 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     560


         ATGTTATTATTTGTATGAAATTTTGTTATATATTTTAGATATAATTTGAAATATTGTTTA
    1681 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1740
         M  L  L  F  V  W  N  F  V  I  Y  F  R  Y  N  L  K  Y  C  L   
     561 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     580


         TTTTTTTGTATTTTGTGAATATTGTATGTATAA
    1741 ---------+---------+---------+---  1773
         F  F  C  I  L  W  I  L  Y  V  * 
     581 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +        590