Gene: NADH dehydrogenase 4 (ND4) 
Species: Trypanosoma brucei
Edited/unedited: not edited
Notes:




DNA      ATGTTAAAATTAAATTTAATATGTATAAATTTTATATTGTTAATTGTTACAATAATATAT
       1 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  60
AA       M  L  K  L  N  L  I  C  I  N  F  I  L  L  I  V  T  I  I  Y   
       1 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    20


         ATATATATAAACTATAGTTTTTGTATTGGAATAGAAATCAATTATGTATATGTAAATATA
      61 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  120
         I  Y  I  N  Y  S  F  C  I  G  I  E  I  N  Y  V  Y  V  N  I   
      21 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     40


         TATTTAAATTACATCAGTCTATGATTTGTATTTTTTATGGGAATTATTATGTACATATTA
     121 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  180
         Y  L  N  Y  I  S  L  W  F  V  F  F  M  G  I  I  M  Y  I  L   
      41 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     60


         ATATTTTTATTATCAAAGAAATGTGTATCATATAATAAATATTTTTACATAGTAATGATA
     181 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  240
         I  F  L  L  S  K  K  C  V  S  Y  N  K  Y  F  Y  I  V  M  I   
      61 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     80


         TATATGTATATATATATTAATGTAGTGTTAATAATAATATTAGATGATTTTATGTGTTTT
     241 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  300
         Y  M  Y  I  Y  I  N  V  V  L  I  I  I  L  D  D  F  M  C  F   
      81 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    100


         ATGATAGCCTTCGAAAGTCTATTTTTCCCTATATGTCTAGTAAGTTTATTTTTTAATTTT
     301 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  360
         M  I  A  F  E  S  L  F  F  P  I  C  L  V  S  L  F  F  N  F   
     101 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    120


         AATAATAGATTTATTTTTGCTATATTCTATCTTATAATATTTAGTTCAGTTAGTTCAGTG
     361 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  420
         N  N  R  F  I  F  A  I  F  Y  L  I  I  F  S  S  V  S  S  V   
     121 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    140


         GTATGTATAATTATATGTATAATAGTAATATCTCATTTCAACATTATAAATTTACAGGCT
     421 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  480
         V  C  I  I  I  C  I  I  V  I  S  H  F  N  I  I  N  L  Q  A   
     141 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    160


         TTTATTGATGTATGTTATTTTGATAGTTTGTATTCGGCAATTTTTATATGAATATTATTA
     481 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  540
         F  I  D  V  C  Y  F  D  S  L  Y  S  A  I  F  I  W  I  L  L   
     161 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    180


         TTTATAATGTTCGCTATAAAATACCCAATCTGACCATTCCATGTGTGACTACCAGAGATG
     541 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  600
         F  I  M  F  A  I  K  Y  P  I  W  P  F  H  V  W  L  P  E  M   
     181 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    200


         CATGTAGAGGTAAATACAGAAATGAGTGTTTTATTAGCAAGTATTGTGCTGAAAATAGGT
     601 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  660
         H  V  E  V  N  T  E  M  S  V  L  L  A  S  I  V  L  K  I  G   
     201 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    220


         TTTTTTGGTGTATACAAATTTTTATTTATCGCATTTAATACGATATCAATATGATTTTTA
     661 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  720
         F  F  G  V  Y  K  F  L  F  I  A  F  N  T  I  S  I  W  F  L   
     221 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    240


         GGTTTTATAGATAGTGTAATTGTGTTGGGTTTAGTATTTATAGCAATGTCACTAATATTT
     721 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  780
         G  F  I  D  S  V  I  V  L  G  L  V  F  I  A  M  S  L  I  F   
     241 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    260


         TTATCAGACTACAAGAAAATAATAGCGAATTGATCAATAATACACACGGGTATAGGATTA
     781 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  840
         L  S  D  Y  K  K  I  I  A  N  W  S  I  I  H  T  G  I  G  L   
     261 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    280


         ATATTATTATGACATAATGACATTTTGTTTGTAGGTTTACTAATATTATGTAATCTAGCA
     841 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  900
         I  L  L  W  H  N  D  I  L  F  V  G  L  L  I  L  C  N  L  A   
     281 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    300


         CATATACTAAGTTCATCCTTTATGTTTATTGTAATAGGATATATGTACGACAATTATGGT
     901 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  960
         H  I  L  S  S  S  F  M  F  I  V  I  G  Y  M  Y  D  N  Y  G   
     301 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +    320


         GTAAGAATTTTTTTATTGTTAATTTCATTTTTTGGTATTAGTATATGAAGTTCATTGTTT
     961 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1020
         V  R  I  F  L  L  L  I  S  F  F  G  I  S  I  W  S  S  L  F   
     321 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     340


         TTATGTTTATTTTTATTTAATATAGATTTCCCGTTTATGTTATTATTTTATGTAGATATA
    1021 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1080
         L  C  L  F  L  F  N  I  D  F  P  F  M  L  L  F  Y  V  D  I   
     341 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     360


         TTTATTTTGTATGGTTTGATATCTATATCATTTATATATATAATAAGTTTTTATATAATA
    1081 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1140
         F  I  L  Y  G  L  I  S  I  S  F  I  Y  I  I  S  F  Y  I  I   
     361 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     380


         ACTTTAACGATATTTTTATCATCAATATACATCTATATGTGTTTAAGTTTTTATTCATTT
    1141 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1200
         T  L  T  I  F  L  S  S  I  Y  I  Y  M  C  L  S  F  Y  S  F   
     381 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     400


         GTATGGTTGGATAAATATCTTAGACTTGATGTTAGTATAAATGATATATATGTATTTATG
    1201 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1260
         V  W  L  D  K  Y  L  R  L  D  V  S  I  N  D  I  Y  V  F  M   
     401 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +     420

 
         TCAATATCAATATCAACTATAGTATTTTATTATTTTATATATTTATTAATATAA
    1261 ---------+---------+---------+---------+---------+----  1314
         S  I  S  I  S  T  I  V  F  Y  Y  F  I  Y  L  L  I  * 
     421 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -        437