Gene: Maxicirle unidentified reading frame 1 (MURF1)
Species: Trypanosoma brucei
Notes: N-terminus uncertain
 


DNA      ACCCCCAAAAAATCCTTGTTTTTATATATCATACACATATTTATATTTCTTATTATCTAC
       1 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  60
AA                K  S  L  F  L  Y  I  I  H  I  F  I  F  L  I  I  Y   
       1          -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -    17


         AGCTTTATTATCTTATGTGATTATACTACACTAACATTACTAAGCTTTGATTTACTCTGA
      61 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  120
         S  F  I  I  L  C  D  Y  T  T  L  T  L  L  S  F  D  L  L  W   
      18 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -     37


         TTATTAATTATTAACCTATTTTGAATAACATTATTAGATTCTTATATTTGTTTCATCTTT
     121 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  180
         L  L  I  I  N  L  F  W  I  T  L  L  D  S  Y  I  C  F  I  F   
      38 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -     57


         ATACTCTTATTCTTATTTTGCTTTACATTATTTTTTTGCTTTCTATCATTCGATACCAGA
     181 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  240
         I  L  L  F  L  F  C  F  T  L  F  F  C  F  L  S  F  D  T  R   
      58 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -     77


         TTTTTATTCATTATTATTATTATTCAATACATTATTATATTCTTATTTATATTTATTAAT
     241 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  300
         F  L  F  I  I  I  I  I  Q  Y  I  I  I  F  L  F  I  F  I  N   
      78 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -     97


         CATATTATTATTATATCAATCCTCTTTGAAATATTTAGCTTATTGCTCTTTTTATTATTA
     301 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  360
         H  I  I  I  I  S  I  L  F  E  I  F  S  L  L  L  F  L  L  L   
      98 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -    117


         ATGTCCAGTAGATTTGGATATAAAATTTTAGTTCTATGATATTACTACATGTTAAACTTA
     361 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  420
         M  S  S  R  F  G  Y  K  I  L  V  L  W  Y  Y  Y  M  L  N  L   
     118 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -    137


         ATAAATTTTATATTATTATTTATATTATTATATTTTATGATATTAAACTACTGTTTTTTC
     421 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  480
         I  N  F  I  L  L  F  I  L  L  Y  F  M  I  L  N  Y  C  F  F   
     138 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -    157


         CTATGTGATTTTTGTTTTTTAGTTTTTGATGAAGAATGACTTGGAATTTTATGCCTATTT
     481 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  540
         L  C  D  F  C  F  L  V  F  D  E  E  W  L  G  I  L  C  L  F   
     158 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -    177


         TACACATTATTAATTTTATTCAAATTATACATCGCCTTTTTAATTTTGTTTATGGAGCAA
     541 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  600
         Y  T  L  L  I  L  F  K  L  Y  I  A  F  L  I  L  F  M  E  Q   
     178 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -    197


         CTTTATATTAGACTTGGTGTCTTTATTTTTATTTATATGTTAACTTTTTATATTTTGTTT
     601 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  660
         L  Y  I  R  L  G  V  F  I  F  I  Y  M  L  T  F  Y  I  L  F   
     198 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -    217


         TGTTTTATATTAATAATTCTACTAATTAGCTTCATTTATTTTTATATTTTATTCATCAAA
     661 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  720
         C  F  I  L  I  I  L  L  I  S  F  I  Y  F  Y  I  L  F  I  K   
     218 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -    237


         CTTCTATTATTTCAATCTTGTACATGCGTTTTAATTGGATTAAACAGCTTTGCTATCGTT
     721 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  780
         L  L  L  F  Q  S  C  T  C  V  L  I  G  L  N  S  F  A  I  V   
     238 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -    257


         AGTTTACTATTTGTGTTAAGTGTGAATAATTTTTGCTTTTTATTCCTAATATTTATTTCA
     781 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  840
         S  L  L  F  V  L  S  V  N  N  F  C  F  L  F  L  I  F  I  S   
     258 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -    277


         ACAAAAAATTATATCTTTTATTTATATTTAAATTTTCACTTAATTTATAGTATAAGTTTA
     841 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  900
         T  K  N  Y  I  F  Y  L  Y  L  N  F  H  L  I  Y  S  I  S  L   
     278 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -    297


         GTATTACTTATTATTATATACTATTTTTTTATTATATATAATATTTTTGACTTTAAATAC
     901 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  960
         V  L  L  I  I  I  Y  Y  F  F  I  I  Y  N  I  F  D  F  K  Y   
     298 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -    317


         AATGAAAACTATTTTTTAATCAACTTCATATTTTTTTCTTTTTTTAATAACTTTTTAATA
     961 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1020
         N  E  N  Y  F  L  I  N  F  I  F  F  S  F  F  N  N  F  L  I   
     318 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -     337


         AGTTTACTACTTGCATGTCTCTTTCTTTGCATTGGAGCTATTCCAATTGTATTTGGATTT
    1021 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1080
         S  L  L  L  A  C  L  F  L  C  I  G  A  I  P  I  V  F  G  F   
     338 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -     357


         TTTATCAAAGTTTTCTGTCTATTATTACAACTAAGTTACCTTTGTATTTGTATTGGCTTT
    1081 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1140
         F  I  K  V  F  C  L  L  L  Q  L  S  Y  L  C  I  C  I  G  F   
     358 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -     377


         TTCTTTATAATATGACTTATTATCATTTATATTTTTTATTTTAGATTAATTGTTAATATA
    1141 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1200
         F  F  I  I  W  L  I  I  I  Y  I  F  Y  F  R  L  I  V  N  I   
     378 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -     397


         TTTATTTTTTCTTATCAATTTCTTGGTTTTTGAGTTGTAAAATTATCTTTTATCAATATT
    1201 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1260
         F  I  F  S  Y  Q  F  L  G  F  W  V  V  K  L  S  F  I  N  I   
     398 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -     417


         AAAAATTTATTATTCTTCATTTGTTCTAGCGTATATATACTTTTCTTTGATATTATTAAC
    1261 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+  1320
         K  N  L  L  F  F  I  C  S  S  V  Y  I  L  F  F  D  I  I  N   
     418 -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -     437


         TTATTTGATCTTATTCTATAACT
    1321 ---------+---------+---  1343
         L  F  D  L  I  L  *     
     438 -  -  +  -  -  -          443