Gene: Cytochrome oxidase 1
Species: Trypanosoma brucei
Edited/unedited: not edited
Notes:
DNA ATGTTTTTTCTATGTCTTGTGTGCTTAAGTGTTTCTCATAAAATGATTGGAATTTGTTAT
1 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 60
AA M F F L C L V C L S V S H K M I G I C Y
1 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 20
CTTTTAGTTGCTATTTTATGTGGATTTATCGGTTATATTTACTCCTTATTTATTAGATTA
61 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 120
L L V A I L C G F I G Y I Y S L F I R L
21 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 40
GAACTTTCTCTAATTGGTTGTGGAGTTTTATTTGGTGATTATCAGTTTTACAACGTACTC
121 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 180
E L S L I G C G V L F G D Y Q F Y N V L
41 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 60
ATTACTTCACATGGGTTGATTATGGTTTTTGCTTTTATTATGCCTATAACTATGGGTGGG
181 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 240
I T S H G L I M V F A F I M P I T M G G
61 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 80
TTTACAAACTATTTTGCGCCCGTCATGGTTGGGTTTCCCGATATGGTATTTCCTCGTATA
241 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 300
F T N Y F A P V M V G F P D M V F P R I
81 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 100
AATAATATGAGCTTTTGAATGTTTATTGGAGGATTTGGTTGCTTAGTAAGTGGGTTTTTG
301 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 360
N N M S F W M F I G G F G C L V S G F L
101 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 120
ACTGAAGAGGGTATGGGGGTTGGTTGGACCTTGTATCCTACGTTGATTTGTATTGATTTT
361 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 420
T E E G M G V G W T L Y P T L I C I D F
121 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 140
CATTCTAGCTTAGCATGTGACTTTATCATTTTCTCTGTGCATTTTCTTGGTATATCTAGT
421 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 480
H S S L A C D F I I F S V H F L G I S S
141 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 160
ATATTAAATTCCATTAATGTTGTAGGTACAATTTTTTGCTGTAGACGAAAATATTTTAGC
481 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 540
I L N S I N V V G T I F C C R R K Y F S
161 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 180
TTTCTTATTTGAACACTTTTTATTTGAGGTGCCTTGTTGACATCCATACTTTTGATTATT
541 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 600
F L I W T L F I W G A L L T S I L L I I
181 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 200
ACACTTCCCGTTTTGGCTGGTGGAGTTACATTATTATTATGCGATAGAAATTTTAACACA
601 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 660
T L P V L A G G V T L L L C D R N F N T
201 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 220
TCATTTTATGATGTTGTTGGAGGTGGAGATCTAGTTTTATTTCAACACTTATTTTGGTTC
661 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 720
S F Y D V V G G G D L V L F Q H L F W F
221 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 240
TTTGGACATCCAGAGGTTTATATCATAATTCTACCTGTATTTGGATTAGTTTCCACTATT
721 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 780
F G H P E V Y I I I L P V F G L V S T I
241 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 260
ATTGAAGTTACAAGTTTTAGATGCGTTTTTAGTTCCGTCGCTATGATTTATTCTATGCTA
781 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 840
I E V T S F R C V F S S V A M I Y S M L
261 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 280
CTGATATCTGTATTAGGTATGTTTGTTTGAGCGCATCACATGTTTGTTGTTGGTATGGAT
841 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 900
L I S V L G M F V W A H H M F V V G M D
281 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 300
GTTGATTCTAGAGCTTATTTTGGAAGTATTACTGTACTAATAGGCTTACCTACATGCATT
901 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 960
V D S R A Y F G S I T V L I G L P T C I
301 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 320
AAATTATTTAATTGAATCTATAGCTTCTTATTCACAGATATGTGTATTTGTTTTGAAATT
961 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1020
K L F N W I Y S F L F T D M C I C F E I
321 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 340
TATTTTATATATATGTTTATACTTATGTTTCTTGCTGGTGGATTAACTGGCTTATTTCTA
1021 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1080
Y F I Y M F I L M F L A G G L T G L F L
341 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 360
TCAAATGTTGGTATTGATATTTTGATGCATGATACTTATTTTGTTGTTGCACATTTCCAC
1081 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1140
S N V G I D I L M H D T Y F V V A H F H
361 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 380
TATGTTTTATCACTTGGTGCTGTTGTAGGGGTTTTTGGTGGGTTTTTTCATTTTCTCATG
1141 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1200
Y V L S L G A V V G V F G G F F H F L M
381 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 400
AAATGAATTCCTATTGAACTTCACACATTTTGATTATTTTTCTTCATTTCCACATTATGA
1201 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1260
K W I P I E L H T F W L F F F I S T L W
401 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 420
TTTGGTTCTAATATGGTTTTTTTTCCTTTACATAGCTTAGGAATGTTTGCTTTTCCAAGA
1261 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1320
F G S N M V F F P L H S L G M F A F P R
421 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 440
AGAATTTCTGATTATCCTATCAGCTTTTTATTTTGAAGTGCGTTTACATTGTATGGTATG
1321 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1380
R I S D Y P I S F L F W S A F T L Y G M
441 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 460
CTTTTGTTGACTTTTTTAGTTATATTTTGCTGTTGTTTGTTTAATGTTATATTATTCTGA
1381 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1440
L L L T F L V I F C C C L F N V I L F W
461 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 480
GATTACTGTTTATTTTTTATTAATTTGTTTACATATAGCTTATCTATATTCTTCTATTTT
1441 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1500
D Y C L F F I N L F T Y S L S I F F Y F
481 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 500
TATACATGAGTACCAGTTTGTATGGCTATTTATTTACTTGTTATTGATTTTGCGCATATA
1501 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1560
Y T W V P V C M A I Y L L V I D F A H I
501 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 520
ATACTTGACTATTTATTAATAATACTTTGCTTTTGCTTCGTATTTTATATTTTTTTTTGA
1561 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1620
I L D Y L L I I L C F C F V F Y I F F W
521 - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + 540
CAAGCCTTCCTATTATTCTTTTATATATAA
1621 ---------+---------+---------+ 1650
Q A F L L F F Y I *
541 - - - - - - - - - 549