Gene: Cytochrome oxidase 1
Species: Leishmania tarentolae
Edited/unedited: not edited
Notes:



         ATGTTTTGACTTTGCCTCGTTTGTCTTAGTGTGTCACATAAAATGATTGGTTTATGTTAT
       1 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 60
         M  F  W  L  C  L  V  C  L  S  V  S  H  K  M  I  G  L  C  Y   
       1 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   20


         CTTTTAGTTGCAATCCTTTCAGGATTTGTTGGATATGTTTATTCATTATTTATTAGATTA
      61 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 120
         L  L  V  A  I  L  S  G  F  V  G  Y  V  Y  S  L  F  I  R  L   
      21 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   40



         GAACTTTCACTTATAGGATGTGGTATTTTATTTGGAGACTATCAGTTTTATAATGTTTTA
     121 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 180
         E  L  S  L  I  G  C  G  I  L  F  G  D  Y  Q  F  Y  N  V  L   
      41 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   60

         ATTACTTCTCACGGATTAATTATGGTTTTTGCTTTTATAATGCCTGTTATGATGGGTGGT
     181 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 240
         I  T  S  H  G  L  I  M  V  F  A  F  I  M  P  V  M  M  G  G   
      61 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   80

         CTTGTAAATTATTTTATTCCTGTTATGGCTGGGTTTCCAGATATGGTATTTCCTCGACTT
     241 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 300
         L  V  N  Y  F  I  P  V  M  A  G  F  P  D  M  V  F  P  R  L   
      81 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   100

         AACAATATGAGTTTTTGAATGTACTTAGCAGGATTTGGTTGTGTCGTTAATGGGTTTTTA
     301 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 360
         N  N  M  S  F  W  M  Y  L  A  G  F  G  C  V  V  N  G  F  L   -
     101 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   120

         ACAGAAGAGGGCATGGGTGTCGGATGGACATTATATCCAACTTTAATATGTATAGATTTT
     361 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 420
         T  E  E  G  M  G  V  G  W  T  L  Y  P  T  L  I  C  I  D  F   
     121 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   140

         CATTCAAGTTTAGCCTGTGATTTTGTTATGTTTGCTGTGCATTTACTAGGTATATCTAGT
     421 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 480
         H  S  S  L  A  C  D  F  V  M  F  A  V  H  L  L  G  I  S  S   
     141 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   160

         ATTTTAAATTCTATAAATTTACTCGGCACTTTATTCTGTTGCCGTAGAAAATTCTTTAGC
     481 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 540
         I  L  N  S  I  N  L  L  G  T  L  F  C  C  R  R  K  F  F  S   
     161 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   180

         TTTTTATCTTGATCTCTATTTATTTGAGCTGCTCTTATAACTGCTATACTTTTAATAATT
     541 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 600
         F  L  S  W  S  L  F  I  W  A  A  L  I  T  A  I  L  L  I  I   
     181 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   200

         ACTTTACCTGTATTAGCTGGTGGTGTTACATTAATATTATGTGATAGAAATTTTAATACA
     601 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 660
         T  L  P  V  L  A  G  G  V  T  L  I  L  C  D  R  N  F  N  T   
     201 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   220

         TCATTTTATGATGTTGTGGGTGGTGGTGACTTAATACTATTTCAACATATTTTTTGATTT
     661 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 720
         S  F  Y  D  V  V  G  G  G  D  L  I  L  F  Q  H  I  F  W  F   
     221 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   240

         TTTGGTCATCCTGAAGTATATATTATATTACTTCCTGTTTTTGGTTTAATATCTACTATT
     721 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 780
         F  G  H  P  E  V  Y  I  I  L  L  P  V  F  G  L  I  S  T  I   
     241 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   260

         GTAGAAGTTATCGGGTTTCGTTGTGTTTTTAGTACTGTTGCTATGATATACTCTATGATA
     781 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 840
         V  E  V  I  G  F  R  C  V  F  S  T  V  A  M  I  Y  S  M  I   
     261 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   280

         TTAATTGCTATTTTAGGTATGTTTGTCTGAGCGCATCATATGTTTGTAGTAGGTATGGAT
     841 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 900
         L  I  A  I  L  G  M  F  V  W  A  H  H  M  F  V  V  G  M  D   
     281 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   300

         GTTGACTCTAGAGCTTACTTTGGTGGTGTTTCAATTTTAATTGGATTGCCTACATGTGTT
     901 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 960
         V  D  S  R  A  Y  F  G  G  V  S  I  L  I  G  L  P  T  C  V   
     301 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   320

         AAACTATTTAACTGAATTTATAGTTTCTTATATACTGATATGATTATTACATTTGAAGTT
     961 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1020
         K  L  F  N  W  I  Y  S  F  L  Y  T  D  M  I  I  T  F  E  V   
     321 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   340

         TACTTTGTTATAATGTTTATTTTTATGTTTTTAATTGGTGCCGTGACAGGTCTTTTTTTA
    1021 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1080
         Y  F  V  I  M  F  I  F  M  F  L  I  G  A  V  T  G  L  F  L   
     341 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   360

         TCAAATGTAGGCATAGATATAATGCTGCATGACACTTACTTCGTAGTTGGTCACTTTCAT
    1081 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1140
         S  N  V  G  I  D  I  M  L  H  D  T  Y  F  V  V  G  H  F  H   
     361 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   380

         TATGTTTTATCATTAGGTGCGGTAGTTGGATTTTTTACAGGTTTTATACACTTCCTTGCT
    1141 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1200
         Y  V  L  S  L  G  A  V  V  G  F  F  T  G  F  I  H  F  L  A   
     381 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   400

         AAATGACTACCTATAGAACTATACCTTTTTTGAATGTTCTACTTTATTAGCACATTATTT
    1201 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1260
         K  W  L  P  I  E  L  Y  L  F  W  M  F  Y  F  I  S  T  L  F   
     401 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   420

         ATAGGAAGTAATATGCTTTTTTTTCCAATGCATTCTTTAGGTATGTATGCATTTCCTCGT
    1261 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1320
         I  G  S  N  M  L  F  F  P  M  H  S  L  G  M  Y  A  F  P  R   
     421 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   440

         AGAATATCTGACTATCCTGTGTCATTTTTATTCTGAAGTTCATTTATGCTTTACGGTATG
    1321 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1380
         R  I  S  D  Y  P  V  S  F  L  F  W  S  S  F  M  L  Y  G  M   
     441 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   460

         TTATTACTTGCCAGCTTAATATTATTTTTATGTGCACTTTTCTGTGTTTTTTTATTTTGA
    1381 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1440
         L  L  L  A  S  L  I  L  F  L  C  A  L  F  C  V  F  L  F  W   
     461 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   480

         GATTACTGCTTATTTTTTGTTAGCTTATTTGTATTTAGCCTTTACTGTTTTTTCTATTTT
    1441 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1500
         D  Y  C  L  F  F  V  S  L  F  V  F  S  L  Y  C  F  F  Y  F   
     481 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   500

         TCAACTTGACTACCTTGTGTAATGGTTTTATATTTATTACTTGTAGACTTTGCACATATA
    1501 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1560
         S  T  W  L  P  C  V  M  V  L  Y  L  L  L  V  D  F  A  H  I   
     501 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   520

         GTGTTAGACTACTTATTTTTAATTTTATGCTTCTGCTTTGTTTTTTTTATATTTTTTTGA
    1561 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1620
         V  L  D  Y  L  F  L  I  L  C  F  C  F  V  F  F  I  F  F  W   
     521 -  -  -  -  -  -  -  -  -  +  -  -  -  -  -  -  -  -  -  +   540

         CAATCTTTATTTTTATTTTTTTATATATAA
    1621 ---------+---------+---------+ 1650
         Q  S  L  F  L  F  F  Y  I  *   
     541 -  -  -  -  -  -  -  -  -      549